Cell | 建立人类树突状细胞与如前所述T细胞相互作用模型

线粒体-线粒体耦合异常简单，限于大量小分子与讯号闭环，学界钻研多年，仍旧是管当中窥豹。来自美国纽约PSL图表研究大学的Vassili Soumelis团队于在Cell杂志上发表题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的篇名，建起了科学实验与理论基本概念结合的图表研究工具，科学实验上，在胺基酸水平验证了线粒体所分泌的线粒体因子与应激反应；理论基本概念上，建起了讯号输入负载当中间的联系和耦合关连。编者以生命树突锥形线粒体（Dendritic cell，缩写DC）与辅助性T线粒体（T Helper cell，缩写Th）当中间的耦合为图表研究单纯，研究了36例DC相关的讯号小分子和17种Th分泌的线粒体因子，并倚靠这些图表建起数学模DF，演算出56种早就被科学实验表明的线粒体并不一定，与此同时，还推测出290种可能关连，并表明了IL-12p70可以通过IL-1讯号闭环游离17DF辅助性T线粒体（缩写Th17）。首先，编者采集了生命单核线粒体来源的DC（MoDCs）和外周血液CD11c+DC（bDCs）两类线粒体，并焦虑24小时。所选用的焦虑讯号主要都有三大类余14种。第一种：内源讯号小分子，仅限于干扰素beta（interferon β，缩写IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样特异性的配基，仅限于Toll4特异性的-HT脂多糖（ lipopolysaccharide，缩写LPS），Toll1/2特异性-HTPAM3CSK4，Dectin1-HTCurdlan，Toll2/Dectin1-HT zymosan，Toll7/8特异性-HTR848，Toll3特异性-HT poly(I：C) 和NLRP3炎症小体活化剂铝钾；第三种：细细菌病毒，仅限于低温灭活的Candida albicans （缩写HKCA），西汉姆联细菌（Listeria monocytogenes，缩写HKLM），Staphylococcus aureus （缩写HKSA）， Streptococcus pneumoniae （缩写HKSP）和菌株（influenza virus，缩写flu）。整整，编者通过流式线粒体术等工具，验证了36种DC相关小分子的表述情况，其当中，29种位处线粒体表面会，7种位处线粒体分泌上明末清初之当中。结果显示，除了一些已知的DC线粒体自发之外，编者还有了一些属于自己断定：（1）zymosan焦虑的MoDCs 表述高水平的CD54 和PVR；（2）菌株焦虑的MoDCs可以游离ICOSL；（3）LPS焦虑的MoDCs 可以游离高水平的CD30L和CD83。再下来，编者将这些焦虑过的DC与T线粒体五小6天，随后验证Th的增生效率以及17种Th相关线粒体因子的表述分泌情况。寻常的是，编者将Th和DC的观感彼此之间比较，断定，这二者当中间并不存在一一对应的关连，并不一定，两种焦虑物对DC造成了的优点类似，但是，这两种焦虑物所处理的DC与T线粒体五小便，造成了的优点很可以截然完全相同。接着，编者选用生物信息学的工具，以上述科学实验图表建起模DF。简单来说，编者综合DC负载的36种讯号小分子和Th负载的17种effect小分子，将两两当中间的关连一般化为“可借管控”和“正向管控”两种，并且，还重新加入目录和已发表文献当中的信息，建起了简单的讯号管控网路。例如，通过这一模DF，编者断定， IL-10的正向管控小分子仅限于OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而可借管控小分子仅限于Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，给予DC完全相同的焦虑讯号，编者就可以相符Th自发线粒体IL-10的表述分泌情况。最后，编者利用这样模DF，试图推测并表明属于自己线粒体并不一定。通过建起的模DF，编者断定，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2协力分泌时，偏好于管控IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 协力出现时，则更偏好于管控IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的表述水平都显着增加。这些结果解释，IL-12作准备Th17的游离发挥作用。为了全面探讨IL-12游离Th17的机制，编者选用肾脏游离Th的模DF，断定，IL-12并不能直接游离Th17，但是，同时重新加入IL-1和IL-12，Th17就游离出来了。这是一篇科学实验与理论基本概念结合的代表作品。科学实验结果与计算仿真彼此之间支持，彼此之间指导，相辅相成。如下图所示，科学实验大部分选用了密不可分关联两大部分图表，一是何种焦虑下DC线粒体的自发，二是自发后的DC对T线粒体的作用。理论基本概念大部分以DC和T线粒体的负载线粒体因子为核心，建起了线粒体因子当中间的可借和正向管控网路模DF。通过这一模DF，编者展示出一些属于自己线粒体间并不一定，最终再用科学实验表明这些关连是否属实。这篇名的亮点有一处，一是建起和科学实验理论基本概念结合图表研究的范本，二是篇名当中透过的诸多线粒体管控信息以供图表研究参考。原始来历：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.